1.區域不同:寧波保稅區位於北侖，北侖區是寧波的壹個區。
2.成立時間不同:寧波保稅區於1992 11在國務院批準成立，北侖區於1984成立。
3.功能不同:寧波保稅區主要有進出口加工、國際貿易、保稅倉儲三大功能，而北侖區是浙江省最大的港口和外貿口岸，具有港口、產業、城市三大功能。