校長由市教育局從公辦學校中推薦，第壹任校長為鄭建安（2003—2008），原寧德壹中校長；第二任校長為張鳳傑（2009—2010），第三任校長為甘耀光（2011—2012），原寧德壹中副校長、寧德市蕉城區宣傳部副部長；現任校長李祥坦，全國優秀校長、中國管理科學研究院研究員、全國知名教育專家。