法律分析：1、登錄自然人電子稅務局（扣繳端）；2、點擊退付手續費核對按鈕；3、等待系統自動查詢出退付手續費信息後核對數據是否準確，具體數據可與查詢統計-單位申報記錄查詢中的申報信息進行詳細核對，核對時需註意稅款所屬期和實際入庫期問題；4、核對無誤後，點擊我已核對無誤按鈕提交、確認。後續無需其他操作，等待稅務局通知即可。
個人所得稅代扣代繳手續費返還，可以通過登錄自然人電子稅務局扣繳端申請，具體步驟如下：
1、首先登錄自然人電子稅務局扣繳端；
2、進入扣繳端界面，點擊左側菜單欄下方“退付手續費核對”——點擊“獲取結報單”——等待系統自動獲取結報單和單戶核對清冊；
3、核實結報單和單戶核對清冊當中的內容——無誤後，點擊“我已核對無誤”——進行提交；
4、系統彈出“代扣代繳手續費退費申請”——選擇“開戶銀行”、“銀行賬號”、“開戶銀行網點”——閱讀聲明——提交——彈出“確認信息”彈框——點擊確定。
完成以上步驟後，經稅務機關審核完成後，即可返還相應的手續費。
法律依據：《中華人民***和國個人所得稅法》 第九條 個人所得稅以所得人為納稅人，以支付所得的單位或者個人為扣繳義務人。