企業所得稅的零申報，是針對納稅人的應納所得稅額而言的，即納稅人當期（月份、季度或者年度）的應納稅額為“零”或者“零”以下的情況，也應當向主管稅務機關填報納稅申報表，而不是僅對“零”以上的數據辦理納稅申報。在這裏要把“納稅申報”程序和“稅款繳納”程序區別開來。“納稅申報”就是不管納稅人當期是否實現有效的應納稅款（因為在實際操作中，應納稅額有可能是“零”或者負數），都應該向主管稅務機關報送納稅申報表，以明確涉稅法律責任。
不管應納稅額是正數的情況，還是零和負數的情況，是僅就其計算結果而言的。並不代表應納稅額的形成過程，例如銷售收入、成本費用支出、攤銷等情況。如果納稅人的應納稅額為非正數的情況，仍然就其經營資金的增減變化和運動過程進行靜態和動態反映，通過納稅申報表、會計報表的形式報送主管稅務機關。
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