1，取向不同:經濟法主要側重於經濟活動的組織、管理和規範，如市場競爭、企業組織和合同法等，而生態補償法律制度以保護自然環境和生態系統為目的，通過強制或鼓勵行為者進行補償來恢復生態環境，其目標側重於環境保護和自然資源管理。
2.研究對象不同:經濟法的研究對象主要是經濟主體的權利義務關系和對經濟活動的規範與管理，而生態補償法律制度的研究對象是自然資源的保護、生態環境的修復和生態利益的分配，側重於自然資源的可持續利用和生態環境的可持續發展。
3.規則制定的目的和原則不同:經濟法的規則制定主要是為了促進經濟發展，保護市場秩序，維護公平競爭，而生態補償法律制度的規則制定主要是為了補償對環境造成負面影響的行為者，從而實現生態環境的修復和保護，維護生態系統的平衡。