1.概念:系主任負責壹個學院、系、部的教學、科研、管理的全面領導，而系秘書則是系主任的副手。
2.職責:系主任主要組織協調本系的教學、科研和管理工作，而系秘書則協助系主任處理本系的日常工作和突發事件。
壹般來說，部門主管和部門秘書的職責是有區別的。部門負責人負責具體工作，部門秘書則側重於思想指導和工作協助。