小產權房買賣合同是買賣雙方簽訂的文件，記載了買賣雙方的意思表示和訂立的條款，具有法律約束力。買賣雙方在履行合同時，可以根據合同提出要求或追究責任。
轉讓協議是關於小產權房所有權轉移的協議。是買賣合同後簽訂的文件，記載小產權房所有權轉移。轉讓協議不具有獨立的法律效力，而是取決於買賣合同的法律效力。因此，小產權房買賣合同比轉讓協議具有更強的法律效力。