行政訴訟主體資格取消的處理:1。原告被撤銷資格的，裁定不予受理或者駁回起訴；2.如果被告不合格，原告應更換被告；原告不願改變的，人民法院應當裁定駁回起訴。
法律客觀性:
《行政訴訟法司法解釋》第二十六條，原告起訴的被告不合格的，人民法院應當告知原告更換被告；原告不同意變更的，應當駁回起訴。應當追加被告，原告不同意追加的，人民法院應當通知其作為第三人參加訴訟，但行政復議機關是被告的除外。