保護區設有信陽市平遙區城陽城遺址保護委員會、信陽市平遙區城陽城遺址保護政府、信陽市平遙區城陽城遺址保護區人民武裝部，並成立了城陽城遺址文物保護派出所，專職文物保護。
保護區機構健全，功能齊全。下設兩級機構:文物執法大隊、黨政辦、計劃生育服務中心、村鎮建設發展服務中心、農村經濟發展服務中心、會計工作站、勞動和社會保障所、民政所、綜治工作中心、群眾工作站、統計工作站。