如果地基中有暗河、溶洞，損失可以由甲方索賠，但需要根據不同的責任由甲乙雙方分別承擔。根據我國相關法律規定，對於不可抗力事件造成的費用，雙方按照以下原則承擔和調整工程價款:(1)發包人承擔工程本身的損壞、工程損壞造成的第三方人員傷亡和財產損失、運至施工現場的待安裝材料和設備的損壞；(2)發包人和承包人應對人員傷亡負責並承擔相應費用；(3)承包人施工機械設備的損失和停工損失由承包人承擔；(4)停工期間，承包人應發包人要求留在施工現場的必要的管理人員和保安人員的費用由發包人承擔；(5)清理和修復工程的費用由發包人承擔。