專項資產管理計劃投資限制少，但需要證監會逐壹審批，運作效率低。基金子公司專項資產管理計劃的投資範圍更廣。
同時，在銀行與證券公司的合作中，證券公司募集的資金不得投向高汙染、高能耗等國家明令禁止的行業；但基金子公司不受約束。股票質押式回購中，證券公司資管的定向和集合可以參與，基金子公司不能直接參與。
法律依據:《關於規範證券公司與銀行合作開展定向資產管理業務有關事項的通知》。