公司在做工傷認定時，如果材料確實需要員工簽字的，應該由員工簽字；但是，如果不要求員工簽名，員工可以不簽名。申報工傷需提交的材料有:
1，工傷認定申請表；
2、與用人單位的勞動關系證明；
3、病例、診斷等病歷；
4、職業病，需提供診斷證明或職業病診斷鑒定。
法律客觀性:
工傷保險條例
第十八條
申請工傷認定時，應當提交下列材料:
(壹)工傷認定申請表；
(二)與用人單位存在勞動關系(包括事實勞動關系)；
(3)醫學診斷證明或職業病診斷證明(或職業病診斷證明)。
工傷認定申請表應當包括事故發生的時間、地點、原因以及職工的受傷程度等基本信息。
申請人按照書面告知要求補正材料後，勞動保障行政部門應當受理申請。