建築公司將自己管理的壹個區域的經營權承包給個人是否合法？合同中的違約條款是否有效？

不合法。經營權是相對於法人財產權而言的。如果對外的合同和公章屬於原施工公司，仍應由原公司承擔責任。《合同法》第二百七十二條第三款:“禁止承包人將工程分包給不具備相應資質條件的單位。”《建築法》第二十六條:“承攬建築工程的單位，應當持有依法取得的資質證書，並在其資質等級許可的業務範圍內承攬工程。”

所以個人是不可能取得資質的，所以壹個人以對外的名義從事建築業務是違法的。