1.職能不同:財政局主要負責宏觀調控、貨幣政策的制定和實施以及外匯市場的管理。銀監局重點監管商業銀行，確保其合規，並通過制定相關規章制度，加強商業銀行的風險防控。
2.組織架構不同:金融局屬於中國人民銀行(央行)下屬機構之壹，直接受央行領導，由央行行長兼任。銀監局是中國銀行保險監督管理委員會(中國銀保監會)的下屬機構，由中國銀保監會主席領導。
3.法律依據不同:財政局的法律依據主要有《中華人民共和國中國人民銀行法》和《中華人民共和國外匯管理條例》。銀監局依據《中華人民共和國商業銀行法》、《中華人民共和國存款保險條例》等相關法律法規開展工作。