1，定義不同。內水是指壹國領土範圍內的河流、湖泊和領水基線向陸壹側的內海、海灣、港口和海峽水域。領海是沿海國主權範圍內與其海岸或內水相鄰的具有壹定寬度的海域，是國家領土的組成部分。領海的空氣空間、海床和底土屬於沿海國的主權管轄範圍。
2.法律是不同的。內水的法律地位:未經沿海國家允許，所有外國船舶不得在內水航行。如果允許外國商船進入壹個國家的國內水域，他們可以遵循該國的法律法規，駛入該國指定的港口。遇險船舶可以進入，但必須遵守沿海國家的規章制度。根據國家的屬地優勢，所有國家都有權對發生在其領海內的壹切犯罪行為行使管轄權，包括發生在外國船只上的犯罪行為。但在實踐中，是否對外國商船在領海內實施的犯罪行使刑事管轄權，各國大多是從犯罪是否涉及自身安全和利益來考慮的。