劇中開頭人物相對模糊的設定給劇情帶來了很多不確定性，懸念貫穿始終。以黑社會集團法律顧問身份出現的李成陽(孫)既有昔日刑警的正義感，又有多年混跡社會的江湖氣息。當初保護黑社會老大馬帥的舉動讓他起了疑心。
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作為壹部以除惡為主題的電視劇，《除惡風暴》在劇情上也有了明顯的突破。劇中的故事，以現實中的大案要案偵查為現實背景，給人們帶來了現實的警示意義，如雲南孫案、湖南操場埋屍案、湖南文烈宏涉黑案、海南案等，都是該劇的靈感素材。
該劇不僅對正義的力量和邪惡勢力進行了非常好的描述，而且以克制和旁觀者的視角保持了消除邪惡和維護司法公正的中心線索。劇中以正義形象出現的羅、何勇、林浩等人在人物塑造上也各具特色。他們不再是模糊的角色，而是有自己的性格特征。