環保稅法的總體思路是由“費”變“稅”，即按照“轉嫁稅負”的原則，實現排汙費制度向環保保稅制度的平穩過渡。條例草案將“保護和改善環境，減少汙染物排放，促進生態文明建設”納入立法宗旨，明確“直接向環境排放應稅汙染物的企業、事業單位和其他生產經營者”為納稅人，並將大氣汙染物、水汙染物、固體廢物、噪聲確定為應稅汙染物。
財政部稅政司司長王表示，實施環保費改稅是落實黨中央、國務院決策部署的重要舉措，有利於解決排汙收費制度執法剛性不足、地方政府幹預等問題；有利於提高納稅人的環保意識和合規性，強化企業治汙減排責任；有利於構建促進經濟結構調整和發展方式轉變的綠色稅收體系；有利於規範政府分配秩序，優化財政收入結構，強化預算約束。