公務員的工資差距主要體現在補貼部分。人力資源和社會保障部勞工和工資研究所進行了壹項調查。現在基本工資占國內公務員工資收入的30%左右，其余是各種補貼和補助。公務員的補貼標準各省不壹致，最高和最低省份有3-4倍的差距。同壹省不同縣市的公務員補貼也有很大差別。部分省份公務員補貼標準多達32項，最低最高相差1.5萬元/年。
2006年6月，國務院頒布了《公務員工資制度改革方案》，提出建立補貼制度，但沒有頒布時間限制。現在公務員的補貼都是各地自己定的。