清同治初年，店屬亳州下轄的胡林堡；同治三年(1864)設漯河縣，將胡林、李彪、張村等13座城堡劃入渦陽縣管轄；清末實行公平長度制，店集公平。
從民國元年(1912)到民國十九年(1930)，沿襲了清末的衛長制。
堤下有村；民國二十年(1931)，張村分區，店內設大聯堡，先屬張村區管轄，後屬江姬區管轄。民國二十八年(1939)至解放前夕，商店設鄉公所，隸屬花溝區。1947處於雙方拉鋸的狀態。1948解放後，店集所轄區域現在壹部分屬於張村區，壹部分屬於楚店區；1949，設置高拱區，設置店鋪的鄉鎮歸高拱區管轄。1956秋，區並入鄉，店集鄉劃歸張村區管轄；1958年秋，渦陽縣紅旗人民公社高永基層社成立，又稱高永鄉，政社合壹，地址店集，轄高永、店集、胡林、宋牌坊四個小鄉。1961年春，又設高拱區，轄高拱、店集、鹹豐(今王樓)、紅山(今宋牌坊)四個小公社，地址店集；1969年春，撤銷區域社區，成立縣級店集公社(先鋒、紅山)；65438年6月至0977年6月，店集公社分為店集公社和高拱公社。1979年6月復區，設立店集區，轄店集、高拱、胡林、田渺、宋牌坊、王大樓六個公社。1981年王樓公社劃歸公基廟區管轄，1983年改為鄉鎮；1992年2月撤區並鄉，設立店集鄉，轄原店集、宋牌坊鄉地區；1999設置鄉鎮，所轄區域不變。
據傳說，建於2000多年前春秋時期的宮哲宮遺址距離鎮政府僅100米。楚襄王為迎娶女兒而挖掘的五谷河，繞過鎮政府大門，依然碧綠清澈。20世紀60年代，高拱地區成立了電技所。1970年春，成立店集公社，後設店集區。1992年2月底，設置店集鄉，1999年，設置店集鄉。