數量多，涵蓋各個學科，尤其是社會科學、人文科學、教育科學和醫學。質量參差不齊。壹些期刊具有較高的學術水平和影響力，如《菲律賓研究》、《亞洲研究》、《菲律賓政治學雜誌》等。然而，壹些期刊存在壹些問題，如缺乏同行審查，編輯不專業和抄襲。
發展不平衡。有些期刊歷史悠久，有穩定的讀者群，如《菲律賓農業科學家》和《菲律賓工程師》，但有些期刊剛剛創刊或停刊多年。比如《菲律賓社會科學與人文評論》和《菲律賓法律雜誌》。
受眾有限。由於菲律賓學術資源和環境相對落後，國內期刊往往難以引起國際關註和引用，因此其影響力主要局限於菲律賓或東南亞地區。
國際出版商或組織在菲律賓的分支機構出版的學術期刊主要有以下特點:
數量較少，主要集中在自然科學、工程技術、醫學和衛生等領域，如《亞太生物技術雜誌》、《亞太環境科學雜誌》、《亞太公共衛生雜誌》。
質量很高。由於國際出版商或組織的規範和監管，這些期刊通常遵循嚴格的同行評審制度，編輯團隊更加專業和國際化，論文質量和水平也相對較高。