交通事故發生後，雙方自行離開現場後，如能協商賠償金額，可達成壹致。達成協議後壹方不履行，就從原來的侵權責任變成了合同責任。補償義務人不履行補償協議的，合同不可撤銷或者無效，必須按照協議履行。所以交通事故協議是有效的。是否只能按照協議進行賠償，主要看協議是否確認事故事實。如果認定了，並且依法認定的事實賠償數額與協商賠償數額壹致，那麽就可以按照約定進行賠償。否則，雖有約定，但法定賠償金額高於約定金額的，仍應按法定賠償金額賠償。
法律依據:《中華人民共和國道路交通安全法》第七十條
道路上發生交通事故時，車輛駕駛人應當立即停車，保護現場；造成人身傷亡的，車輛駕駛人應當立即搶救受傷人員，並及時報告執勤的交通警察或者公安機關交通管理部門。因搶救傷者改變現場的，應當註明地點。乘客、過往車輛駕駛員、路人應當予以協助。
在道路上發生交通事故，未造成人身傷亡，當事人對事實和原因沒有爭議的，可以立即撤離現場，恢復交通，協商處理損害賠償；不能立即撤離現場的，應當及時報告執勤交通警察或者公安機關交通管理部門。
在道路上發生交通事故，僅造成輕微財產損失且基本事實清楚的，當事人應當先撤離現場，再進行協商。