基本步驟如下:首先，輔助賬要從核算賬簿中調取，最好是同步，即會計對研發支出進行入賬，輔助賬會相應入賬。其次，輔助賬不是從會計賬簿上抄來的，而是根據稅法分析填列的。
填寫表格的順序如下。順序壹:先填研發支出輔助明細賬，再填研發支出輔助明細賬匯總表，最後加扣收表。這樣做的前提條件是研發支出的輔助賬要每天結算，並逐級跟賬。順序二:倒著填，先填加扣收款表，再填輔助賬戶匯總表，最後填輔助賬戶明細表。這樣填寫的條件是:企業平時沒有填寫輔助賬，需要申報備案，臨時抱佛腳，先“打手勢”填表。我敢賭壹塊錢，很多公司都在做這個。需要註意的是，如果補充賬清單不需要備案，企業會保留備查。
填寫表格的規則如下。規則壹:明細科目列表中的數據要匯總到明細科目匯總表中，明細科目匯總表中的數據要匯總到加扣歸集表中。規則2:對於壹個R&D項目，填寫壹個附屬帳戶清單。規則3:壹個研發項目可能處於研究階段、開發階段或完成階段。所以，該支出的要填表，該資本化的要填表。費用化表和資本化表看起來壹模壹樣，不同的是費用化表、期初余額、期末余額和表內余額都填零，而資本化表、期初余額、期末余額和表內余額不僅計數，還註明借款方向。規則4:壹個R&D項目可能采取不同的形式，如獨立R&D和委托R&D，每張表格都需要填寫。規則五:對於很多R&D項目，企業要填寫需要增減的R&D項目明細表，填寫的數據要錄入輔助科目匯總表。企業還應填寫不打算增減的R&D項目明細清單，但不必錄入補充科目匯總表並留存備查，以檢查增減數據的準確性。當然，如果妳嫌麻煩，根本就不要填，估計也沒人會管妳。規則六:無論有多少R&D項目，無論填寫多少輔助賬戶明細，都要匯總成壹個輔助賬戶匯總表，再添加到壹個加法扣款匯總表中。也就是說，壹個企業只報壹個輔助科目匯總表和壹個加扣歸集表。