稅務局查企業偷稅漏稅的方式具體包括：
1、消費者向當地稅務機關舉報；
2、被稽查納稅人上下遊的企業連帶查出問題；
3、系統比對，例如通過涉稅指標分析等方法比對。企業存在異常指標值會被列入風險企業名單，長期零申報或企業所得稅長期報虧損的企業是稅務局重點檢查對象。
稅務稽查指的是由稅務稽查部門依法組織實施的對納稅人、扣繳義務人履行納稅義務、扣繳義務的情況進行全面地、綜合檢查的行為。稅務稽查主要對象是對涉及偷、逃、抗、騙稅的大案要案進行檢查。
強大的系統
金三、金四利用爬蟲技術、大數據的運用，很容易進行比對，比對超出正常值的壹定範圍，系統會預警。預警後，註冊地稅務局那就來詢問，讓抱憑證、發票、協議等到稅局，看了沒問題，那就皆大歡喜，稅局寫報告，消除預警；如果有問題，那就接著深入查，或檢查，或稽查。
專業的涉稅人員
現在稅局的人員業務水平是越來越高了，尤其是區縣級的，壹個是稅局的培訓，二是稅局的相當壹批人有稅務師和註會的證，三是吸收的人考進的多，水平自然不低；四是自我的學習和提高。
信息***享
銀行、工商、財政、稅務、警局、社保.......若有問題，壹比對，就現行。比如，社保由稅局代收，社保和稅局***享企業工資信息，企業沒法造假了，壹造假就現行......
信息協查
別人有問題，協查到妳了。查上下遊企業的時候連帶查出問題。比如現在稅務局大力度查殺虛開增值稅專用發票的企業，連帶就可以查到受票方，不論是不知情者還是可以接受虛開的專票，都有虛假抵扣的風險，這時候就成為稅務機關重點稽查對象了；另外，稅務機關在查某家生產型企業偷漏稅證據時，與之相關聯的公司，比如原材料提供商，銷售對象，都將成為檢查舉證對象，間接地也接受了稅務機關的稽查。
投訴或舉報
這是壹種傳統而有效的方式，線索提供了，壹查壹個準