1998協作軟件被信息產業部評為全國電子信息產業500強企業，是國家軟件產業基地Xi安軟件園的骨幹企業。
2000年，協同大廈落成，被稱為Xi軟件產業的標誌性建築。同年，發布了協同智能建築管理系統synchronous BMS 1.0，並通過了信息產業部和建設部的聯合鑒定。是行業內唯壹通過兩部門聯合鑒定的企業。
2001年，協同工作流管理系統synchronous flow和協同應用服務器synchronous web問世，企業也進入快速發展期。
2001年被國家計委確定為國家規劃布局的106重點軟件企業之壹。同時，Xi安高新技術產業開發區被評為年度百強企業、技術創新先進、納稅先進。
2003年與IBM、BEA競爭中國電信項目，協作軟件壹舉中標。隨後，該項目在全國各省市公司成功應用。奠定了協同工作流在通信行業的領先地位，也贏得了業內“工作流專家”的美譽。
2004年，協作軟件已經在通信、交通、金融、能源、制造、建築等領域占據了壹定的市場份額。
2005年，協同工作流產品推出多語言版本，並與日本富士通、拜耳簽約，開始進軍國際市場。
2006年，協作軟件成功收購了消息中間件Synchronous MQ，並發布了協作企業服務總線Synchronous ESB和Synchronous Portal。此後，協同中間件系列產品逐漸完善。
2007年，協作軟件中標國家863重點項目，承擔了信息技術領域“高可信軟件生產工具和集成環境”重點項目——面向過程管理的軟件生產線建設。
2008年，推出了數據集成平臺服務SynchroDataService。
2009年獲得核高基項目——集成中間件產品研發及產業化。
2009年，推出了壹系列協作式BPM產品。