大多數中小企業的組織結構是建立在專業化分工基礎上的“金字塔”型組織結構，但由於其存在多等級、多層次、機構臃腫，橫向溝通困難，對外界變化反應遲緩等弊端，已不能適應日益復雜、變化多端的市場環境。而在信息技術的支持下，企業可以簡化企業組織生產經營的方式，減少中間環節和中間管理人員，從而建立起精良、敏捷、具有創新精神的“扁平”型組織結構。這種組織形式信息溝通暢通、及時，使市場和周圍的信息同決策中心間的反饋更加迅速，提高了企業對市場的快速反應能力，從而更好地適應競爭日益激烈的市場環境。
信息化能夠有效降低中小企業的成本，打破中小企業高成本、低效率的困局；
信息技術應用範圍涉及整個企業的經濟活動，可以有效地、大幅度地降低企業的費用。主要表現在：企業利用信息技術獲取外部信息如市場信息、產品銷售渠道信息、相關競爭信息等方面的成本降低；計算機輔助設計和制造技術可以使企業降低新產品的設計、生產成本和對現有產品進行修改或增加新性能的成本；庫存管理信息化使企業減少了庫存量，降低了管理成本；信息技術的應用尤其是迅速發展的電子商務大大降低了企業的交易成本。