根據人事制度改革的有關文件精神及單位的工作實際，本著理順職能、提高工作效率的原則，新疆環境保護信息中心內設機構設置為：辦公室、網絡綜合管理科，兩個內設科室。
二、崗位設置
新疆環境保護信息中心核定編制為6人。現有在職人員6人，其中專業技術人員6人，可設高職崗位1個，中職崗位3人，初級崗位2人。
三、環境信息中心職能
新疆維吾爾自治區環境信息中心（以下簡稱信息中心）是新疆維吾爾自治區環境保護局（以下簡稱自治區環保局）直屬事業單位，信息中心作為自治區環保局環境信息管理與技術支持單位，主要任務是發揮全區信息網絡中心、數據通訊中心、信息交流中心與技術服務中心的作用。業務工作由自治區環保局辦公室歸口聯系，其主要工作職責為：
1.貫徹執行國家環境保護環境信息標準和技術規範；承擔國家環保總局衛星通信網（新疆站）建立、維護和使用工作；保障我區環境信息網絡與國家環境信息網絡的正常連通和網上信息的安全傳輸。
2.參與制定全區環境信息工作發展規劃和全區環境信息管理辦法；組織實施自治區環保局批準的全區環境信息化工作計劃和環境信息系統建設。負責編制並實施新疆環境信息及計算機應用工作計劃和規劃。
3.負責建立規範、安全、科學的全區環境信息收集、傳輸、存儲、處理及應用體系；負責組織全區環境、生態信息基礎數據庫的建設與管理；為領導決策和環境管理提供技術支持和咨詢服務。 4.承擔全區環保系統的信息技術使用與應用軟件開發、信息技術和信息管理人員的培訓工作，制定環境信息存儲及數據交換中的各中標準、協議;承擔環境管理應用軟件研究開發和國家環保總局下發軟件的測試和補充功能開發工作。
5.協助區局完成《新疆環境保護局辦公自動化系統》建設，並承擔系統完善、維護和使用人員培訓工作，為自治區環保局的辦公自動化及相關的衛星加密公文傳輸系統的正常安全運行提供技術保障。
6.承擔《新疆環境保護網》網站建設，主頁設計、制作、更新和網站管理與維護，完成自治區環保局政務信息的網上發布工作；按規定協調相關單位完成省級環境信息的匯集、整理、上報和對外發布工作。
7.協助自治區環保局開展全區環保系統信息隊伍的規範化建設和指導下級環境信息中心的業務工作；審批各類進入全區環保系統信息網絡使用的“商業化”或“委托開發”軟件；組織開展全區環境信息技術培訓、技術交流；結合全區環境保護重點工作的要求，開展數據庫技術、GIS技術及計算機與網絡通訊等方面的專題服務。承擔地理信息系統及遙感技術在環境保護中的應用開發任務,組織實施環境基礎數據庫和環境空間數據庫的開發工作。
8.負責指導各地環保系統制訂實施計算機軟硬件及網絡配置方案, 負責全區環保系統計算機技術培訓任務。
9.承擔省局和國家環保總局信息中心下達的其他任務。
四、科室主要職能
（壹）辦公室的主要職能
1、負責環境信息資源傳輸、發布的審查與管理工作；
2、負責我局系統環境信息網絡建設、運行的規劃、管理、協調和指導工作；
3、負責中心的行政、文秘、人事、工資、檔案、醫保、社保、財政、稅務、後勤、職工福利、勞動保障和安全保密工作；
4、負責起草年度工作計劃、總結、報告及會務工作；
5、負責基建項目，政府采購及固定資產、各類軟件、耗材、勞保、圖書資料的采購、登記和管理工作；
6、負責中心內部業務協調及督辦工作；
7、負責中心車輛、辦公設備等的管理工作；
8、接受中心安排的其他工作；
（二）網絡管理科的主要職能
1、負責全區環保系統環境信息網絡技術的培訓工作；
2、負責制定、實施全區環境信息發展規劃、計劃並執行國家環境信息標準和技術規範；
3、負責我局局域網絡及全區環境信息網絡的技術維護與支持工作；
4、負責我局各類應用軟件的正常使用和技術開發工作；
5、負責環境信息網絡的的病毒防範和網絡安全的技術保障工作；
6、負責環境信息應用技術的科研、開發及推廣工作；
7、負責辦公自動化軟件平臺的開發、管理、運行、維護和技術支持工作。
8、負責內外網站維護工作，負責組織、協調內外網站的信息采集、制作、編輯、審核、發布及管理工作；
9、負責中心對外宣傳、廣告策劃制作及承接協作項目工作；負責網頁制作維護。
10、接受中心安排的其他工作