1、在營業執照存在異常情況時，不能直接辦理註銷登記；
2、必須先解決相關的異常問題，例如未按時公示年度報告導致被列入經營異常名錄的，需要先按規定補充公示相關信息；
3、對於因其他原因被列入異常名錄的企業，也需先按照相關規定進行整改，解除異常狀態；
4、異常問題解決後，方可向登記機關提交註銷申請，並按照規定流程辦理註銷手續。
營業執照註銷須知：
1、營業執照每年都要進行年度報告申報；
2、如果不註銷，也不按照規定辦理年度報告申報，會被納入經營異常進行管理；
3、營業執照異常時，應當先調查清楚異常原因；
4、履行相關義務後，申請移出異常名錄；
5、經營場所變更應依法辦理變更登記後，申請移出經營異常名錄；
6、營業執照過期後，仍需辦理註銷登記；
7、不按規定註銷的，會被納入稅務機關的黑名單及工商局的經營異常名單。
綜上所述，營業執照有異常情況時，必須先解決相關問題並按規定流程辦理註銷手續。
法律依據：
《市場主體登記管理條例》
第三十三條
市場主體註銷依法須經批準的，或者市場主體被吊銷營業執照、責令關閉、撤銷，或者被列入經營異常名錄的，不適用簡易註銷程序。