用友T3-財稅通的功能模塊包括：總賬（現金銀行、往來管理）、財務報表、核算、固定資產、稅務核算、出納通。
總賬:財務系統與稅務處理完全集成應用。賬務處理系統以憑證為原始數據，提供日常財務核算功能，民括日常記賬、結賬、銀行對賬、賬證表的查詢與打印。稅務處理系統通過設置會計科目與稅務指標的對應關系，實現憑證與涉稅信息同步解發，在記賬的同時壹並完成涉稅數據采集。
往來管理專業的往來管理不僅減少壞賬損失，加速資金周轉，提高企業經濟效益，而且有利於營造壹個高增值的價值鏈，為企業的長期、快速發展提供良好的經營環境。
現金銀行現金、銀行存款是企業流動資產中最敏感的部分，借助“現金銀行管理”，加強對現金和銀行存款的控制和管理，隨時掌握現金、銀行存款收付的動態和庫存現金余額，確保現金和銀行存款的安全。
財務報表用友財務報表是國內優秀的企業管理軟件工具，與用友賬務系統之間有完善的接口，可根據賬務系統之間有完善的接口，可根據總賬系統提供的憑證、賬表等信息進行歸類、匯總，形成系統、根括性的報表信息，供使用者和管理層分析決策使用。同時財務報表提供與ETAX網上報稅銜接的規範接口。
工資全面的工資管理功能，包括工資錄入、工資計算、所得稅計提、銀行代發、工資分攤處理等。
稅務申報綜合管理稅務綜合管理是本產品的最大創新。通過建立專業的財稅指標體系，本產品將企業的財務核算和稅務處理結合起來，實現企業內部矛盾財務、稅務業務的協同處理和無縫銜接，根據基礎財務數據自動生成納稅申報所需要的各種申報表和電子申報數據。
財稅取數：系統智能化提取財務數據，生成增值稅、所得稅預繳、消費稅、營業稅等稅務申報表。
報表管理：對歷史稅務申報表查詢、比對、統計、分析。以多種形式表現稅款比例分析、稅款變化分析、收入變化分析、成本變化分析、稅負趨勢分析等。
稅法查詢：超大政策數據庫，收錄自1950年以來稅收政策，提供多種查詢檢索功能，幫助用戶快速定位所需政策。
發票查驗：按提示輸入發票代碼、發票號碼、發票密碼等信息，即可查驗全國各地國稅/地稅發票真偽。
辦稅指南：詳細全面的辦稅流程，真實的辦稅過程壹目了然。