1、技術門檻較高：智能制造需要實現信息化、智能化、自動化等高端技術的融合和協同，對人員的綜合素質要求較高，對工程師、技術人員和管理人員等人才要求很高。制造企業可能需要進行組織結構和人才培養轉型，以適應智能制造時代的需要。
2、投資成本較高：為了實現智能制造，制造企業需要投入大量人力、物力和財力，購買高端設備和軟件系統，進行技術改造和升級，在壹定程度上增加了企業的開支成本。
3、安全風險較高：智能制造的高度自動化和信息化特征，使得制造企業的數據信息安全面臨較大的挑戰。壹旦網路被黑客攻擊等安全隱患，不僅會給企業造成不可預知的損失，還可能波及到整個產業鏈上下遊。
4、人性化管理不足：智能制造雖然可以大大提高制造效率和制造品質，但其中往往忽略了人性化管理。機器的數量和自動化的性質意味著人員數量會大量減少，可能會影響企業組織文化、思考能力和管理能力等方面。
5、依賴國外技術和產品：目前，智能制造領域先進的信息技術和高端設備仍然由壹些國外企業主導，制造企業在實施智能制造時，往往需要購買這些國外企業的產品或技術，使得制造企業對國外企業有壹定的依賴。