財務業務壹體化的會計信息系統的功能結構可以分成三個基本部分，他們分別是：財務、購銷存和管理分析，每部分由若幹子系統所組成。
1、財務部分。財務部分主要由總賬（賬務處理）、工資管理、固定資產管理、應付管理、應收管理、成本核算、會計報表、資金管理等子系統組成。
2、購銷存部分。購銷存部分以庫存核算和管理為核心，包括庫存核算、庫存管理、采購計劃、采購管理和銷售管理等子系統。
3、管理分析部分。管理分析部分壹般包括：財務分析、利潤分析、流動資金管理、銷售預測、財務計劃、領導查詢和決策支持等子系統。
信息孤島的影響
由於業務軟件系統局限於業務部門，形成信息孤島，數據***享性差，有些看似復雜卻很普遍的問題都是由很多細節或經驗來支撐的。
隨著企業業務發展，業務流程、單證手續日趨復雜，對於不同產品品種、戰略品種或不同區域，其業務處理呈現出個性化的趨勢。企業在適應這些需要時，要經常處理不同的特殊業務，因此需要有壹套業務部門與財務部門都認可的正規程序、規定，以協同處理這些不同的特殊業務。