(1)寫稅控IC卡。
開票子系統每月到1，企業進入開票系統時，系統會提示:“金稅卡已到了抄稅期，請及時抄稅”。此時，企業必須進行抄稅處理:將本機的稅控IC卡插入讀卡器，選擇“抄稅管理/抄稅處理”菜單，系統將首先檢查本月發票庫中發票數據的完整性，並自動更新本月發票收存月報。如果本月發票數據完整無誤，系統會彈出確認抄稅的提示框，點擊“確認”開始抄稅，完成後系統會給出抄稅成功的提示信息。此時，金稅卡中當前稅額的統計和明細數據已經寫入稅控IC卡。
(2)發票數據的查詢和打印。
寫完稅控IC卡就可以打印各種報表了。點擊“查詢並打印發票數據”，選擇要打印數據的月份和報表打印類型。報表有五種類型:增值稅專用發票匯總表、正發票清單、負發票清單、正發票無效票據清單、負發票無效票據清單。對於各種報告，您可以根據需要打印每個列表，也可以連續打印所有匯總表和列表。打印時，只需在打印選項中選擇所需的報告類型，然後點擊“確定”即可開始打印。
2.網上申報。通過國稅專用申報系統的軟件錄入或導入相關信息生成相關要約文件後，即可在規定期限內(最晚為每月15前，節假日順延)到指定國稅網站進行申報。網上申報的壹般流程是:系統登錄→導入發票信息→生成報關單→發送報告單→獲取抵扣結果→獲取申報結果反饋信息→完成申報。
納稅申報:應該總結為以上兩點。企業要先把電腦上的信息復制到IC卡上，然後網上申報，再把IC卡和相關資料送到稅務局進行數據復制，也就是把信息復制到稅務局系統。