目前我國還缺乏很多項發展電子商務專項規劃，電子商務法規框架已起草多年，至今尚未在全國範圍內容推廣開來。國家發展電子商務還缺乏明確和有力的技術經濟政策。同時現有的行政法規不適應電子商務發展之處未得到及時修訂。研究制定電子商務的相關法律法規較滯緩。美國政府在1997年7月頒布了《全球電子商務綱要》作為美國政府發展電子商務的戰略性政策框架。美國政府電子商務工作組每年報告執行情況，提出政策調整與史新戰略建議，並促進相關政策及戰略的實施。
2.企業信息化建設滯後
目前，我國從整體上講企業的信息化水平還處十落後狀態，多數企業計算機和網絡基礎設施薄弱，有關專業人才缺乏。企業的管理尚未真正實現信息化。並且，我國的人多數企業只重視基礎設施的建設，而忽視了信息資源的綜合利用，因此，由於企業導入電子商務系統過程缺少對信息資源的組織、管理及這方而的應用建設做基礎，往往使此企業處於兩難的境地。
3.電子商務交易的安全性問題
據調查，擔心信用卡號被竊取已經成為影響人們通過網絡進行交易中存在的最大問題。如何在網上保證交易的公正性和安全性，保證交易方身份的真實性，保證傳遞信息的完整性以及交易的不可抵賴性，已成為我國電子商務發展過程中人們最為關心的問題。
電子商務交易中的信息安全漏洞難以堵塞。壹方面是由於缺乏統壹的信息安全標準、密碼算法，協議在安全與效率之間難以兩全；另壹方面，則是由於大多數管理者對網絡安全不甚了解。在我國電子商務的發展過程中，各產業對網絡已逐步出現了高度的依賴性。壹旦計算機網絡受到攻擊而導致電子商務系統不能正常運作，將會對我國的經濟建設造成不可估量的損失。
4.電子商務人才缺乏。
電子商務所需的人才分為三個層次：第壹，技術服務支持層；第二，壹般管理人員；第三，高級管理人員層。
我國第壹層次人員還比較缺乏，電子商務教育在很大程度上忽視了第二層次人員的需求，甚至基木上沒有考慮到第三層次人員的培養，對電子商務教育問題解決不好，電子商務就不可能持續高速發展。