信息化項目管理存在的問題如下：
壹信息化建設中項目立項主要是在項目預算環節，對項目的合理性缺泛嚴謹系統的論證，而具體負責項目預算的業務人員、技術人員對業務宏觀把握能力需要進壹步提升，對於信息應用系統的需求分析能力需要加強。
二對項目技術可行性和經濟合理性研究不夠系統、深入、全面，可行性研究不夠充分。
三項目實施中對政府采購的有關規定還需認真理解、掌握，對於政府招投法的範圍、要求、具體操作程序等認識還要進壹步提高。
四專題培訓需要加強。對技術保障隊伍的培訓和管理需要進壹步加強，團隊建設重視還不夠。
五項目績效科學評價工作需要進壹步完善和提高，需要逐步建立項目建設效果的綜合評價體系。
六項目管理意識，不能真正區分項目實施和項目管理的工作任務，是目前存在的普遍問題。可概括為“沒事做”和“沒人做”並存的現象
七項目成本基礎，系統集成企業，普遍沒有建立專業工程師的成本結構及運用控制體制。因而無法確立和實現項目成本的指標、考核和控制，導致公司與項目經理之間的責任不清
八項目管理制度，或者是企業無項目管理制度，僅憑個人經驗實施項目管理；或者是書生制度，照搬教條，紙上談兵，束之高閣。其結果是，不僅實際的項目管理無所依循，而且也使項目監管層難以落實項目的間接監控和支持。
九專業服務組織，壹是公司策略上將項目實施部門定位為配合系統產品銷售的成本中心，而未能作為壹個獨立核算的業務單元或業務方向；二是基本采取層次性的業務管理性組織結構，而缺乏業務管理和專業管理(諸如運營經理、資源調配、資源開發、行政助理、項目會計、項目質量監控等)的分工合作的矩陣結構；三是缺乏縱向專業深度的設計和結構。
十項目計劃的制定不夠嚴謹，隨意性大，可操作性差，因而實施中無法遵循，缺乏貫穿項目全程的詳細項目計劃，甚至采取每周制定下周工作計劃的逐周項目計劃方式，其實質是“項目失控合法化”。三是項目進度的檢查(與進度計劃比對)和控制不足，不能維護項目計劃的嚴肅性。
十壹項目風險意識，目前市場競爭的激烈和市場的成熟度不足，可能導致應用開發項目的惡性競爭風險。
十二項目經理，業務參與意識不強。
十三項目計劃與財政預算相互不銜接。部分項目資金利用程度不高，或建成後未完全使用。項目建設未按規定程序操作。究其原因，主要是欠缺統壹資金管理。不夠明確投資原則。缺乏統籌管理機制。必要性和重要性