二次大戰後，清除了軍國主義教育的壹套做法，調整了機構和不合理的制度，並去掉了“東京帝國大學”中的“帝國”二字，重新恢復了最早東京大學的校名。改制後的東京大學又新設了基礎學部、教育學部，把東京帝大時的附屬醫學專業部、第壹高中、東京高中亦同時並入，原有學部中又分化出新的學部，壹大批研究所和研究中心相繼成立，今天，東京大學已成為具有 10 大學部， 11 個研究生院， 12 個研究所，數萬師生員工的綜合大學。 1986 年亞洲壹些大學校長和行政管理人員投票評選 10 所世界著名大學時，東京大學作為亞洲唯壹代表入選，這是東京大學的榮耀，也充分證實了它的學術水平。
10 大學部，*** 537 個講座
法學部 為東大歷史最老，也是聲望很高的學部，日本歷史上很多政界要人均出自該學部。設有民主、公法、政治學 3 系，附屬部門有外國法文獻中心，近代日本法政史資料中心。
文學部 設文學、史學、語言學、行動學 4 系，附設文化交流，北海文化研究兩實習實驗部門。該學部亦出過眾多名揚日本的文學家、詩人、俳名作家、藝人等明星。
經濟學部 僅含經濟學、經營學兩系，附屬有日本產業經濟研究室。
教育學部 設教育學、教育心理學、學校教育、教育行政、體育和健康教育 5 系，附屬學校有中學、高中各壹所。
醫學部 有醫學、健康護理學兩系，附設腦研究實驗室、醫學電子實驗室、聲音語言醫學實驗室、實驗動物飼養室，兩所附屬醫院，附屬學校有養護學校、接生護士學校。該學部以外科，特別是腦外科在世界上十分有名。
理學部 設數學、信息科學、物理、天文、地球物理、化學、生物化學、生物科學、地學 9 系，附屬部門有臨海實驗場、植物園、基本粒子物理國際中心、光譜化學研究中心、地殼化學研究室、天文學教學研究中心等。
工學部 東京大學最龐大的學部，含有 23 個系 109 個講座，幾乎覆蓋了所在地工程學科，包括土木、機械、電子、船舶、航空、原子能、資源、金屬、材料、應用化學、應用物理、計算等領域的眾多學科，還設有壹個工程基礎系，壹個原子能工程研究和綜合試驗場。
藥學部 只含藥學、制藥化學兩系，附設藥用植物園。
農學部 開設農業生物學、農業化學、林業學、水產學、農業經濟學、農業工程、獸醫學、林產學 8 系，附設有農場，實習林場、牧場、獸醫院、水產實驗場、綠地植物實驗場等實習實驗設施。
教養學部 負責全校低年級學生的公***基礎課，下分綜合文化、地區文化、社會科學有關學科、系統自然科學、自然科學有關學科 5 系，並設有美國研究資料中心，語言文化中心、數理科學研究室等。
研究生院
研究生院設有人文科學、教育學、法學與政治學、社會學、經濟學、綜合文化、理學、工學、農學、藥學、原子能、數理科學 12 個研究科，***分 104 個專業研究方向。研究生院又具有學部的教學功能，它設有為本科生和研究生授課的教研室壹類組織 95 個，分屬於 10 個相當於系壹級的機構中。
研究所
東京大學的科學研究力量強大，機構眾多，***有 12 個研究所和 13 個供全校乃至全國***同使用的研究中心。
醫學研究所 早在明治時期由痘苗制造所、傳染病研究所、血清藥物院三部分組成，後三家合並為傳染病研究所由內務省管理，戰後改名為醫學研究所置於東大管轄之下。它是東京大學以及日本大學中相當有名的研究所，把傳染病、癌以及其它特殊疾病的有關病理和治療的研究作為主要研究對象。研究的內容有細菌、病毒、寄生蟲等病原物特征特性，致病的病因機理，致病生物的細胞學、分子生物學，遺傳病的發生原因、規律及治療，癌的發生發展，抗癌手段等壹系列當前醫學上重大理論問題和應用問題。***設有 25 個研究室，附設有實驗動物飼養、動物致病試驗，微生物菌株保存，遺傳基因破譯、分子病研究等部門，亦有壹所附屬醫院。該所有許多人員因醫術高明、學業有成在世界上享有盛譽，杉村隆因在胃癌研究中心對癌細胞突變、致癌物的研究成績卓著，曾獲日本文化勛章。在致癌物研究方面知名的人物還有松島泰次郎等人。
地震研究所 是日本該領域唯壹的研究所。 1925 年設立、理論研究項目有地震波，地震發生機理，火山的地質、物理、化學、海嘯，海底地震等；應用研究上有地震、火山、海嘯的預測預報，抗震建築，地震探礦等，還設有強震預測中心和地震預報觀測中心，在全國各地設立有近 20 個地震、火山、海嘯觀測所（站）。
東方文化研究所 致力於東方文化的綜合研究，嚇分泛亞、東亞、南亞、西亞等研究室。其中以對中國的研究最為全面，力量最強，資料十分豐富，研究涉及政治、經濟、軍事、文化、藝術、歷史等領域，附設有東方文化廣獻中心
社會科學研究所 從研究範圍上分為兩方面，壹是社會科學的綜合性研究；二是重在比較方面的研究，目光瞄準當代國際社會，從當代政治、法律、經濟、社會文化等方面進行全球的比較研究。還設有供外來人員參加研究的現代日本社會研究室。
史料編纂所 是歷史悠久的史料館，負責史料的研究、整理編輯和出版。從上至古代、中世紀到近現代的史料，古書散亂記錄，特殊史料均在整理編錄之內。
應用微生物所 研究常見微生物的基本特性及應用，包括發酵工程遺傳育種及保存，酶、抗生素的生物合成工程，活性研究，基因轉換等，附設有微細藻類綜合中心。
生產技術研究所 的前身是東京帝國大學第二工學部，主要從事軍工產品的生產和運用，現為東京大學規模最大的研究所，設有 44 個工程技術研究室，其中多元數值信息處理工程研究室為客座教員研究室。並附設有千葉實驗場，計測技術開發中心，尖端材料開發研究中心，災害減輕國際工程研究中心，特殊電子學研究中心等機構。
社會情報研究所 設有傳播媒體、信息傳播、信息與社會 3 個研究室，附設傳播媒體資料中心。
宇宙線研究所 進行天體物理研究，包括超高能量的強相互作用、弱相互作用，中子物理、宇宙線的觀測及研究等。
原子核研究所 著重於原子核及基本粒子的實驗研究以及有關的基本理論研究，研究內容有原子核瓜，放射能，高能粒子加速器裝置，中子測定，高能粒物理，原子核測定裝置等。其中超高真空學、中間能物理為吸收外國研究學者的客座研究室。
海洋研究所是日本該領域唯壹的研究所，承擔海洋方面的綜合基礎研究任務。有海洋的物理、氣象、海洋的化學、生物學、海底結構及地質、海洋的生態，海洋微生物、海洋資源環境調查，海洋漁業開發等研究室，並擁有兩艘海洋考察船。
物理研究所 進行材料特性實驗研究及有關理論的研究，如物質極限特性，濃縮性，放射性，新材料開發等。其中固體特性、極限特性等二室為客座教員研究部門。
這些研究所中，宇宙線所、原子核所、海洋所、物理所為全國***同使用的研究所。除此以外，東京大學還有 3 個全國***同使用的大型中心：
大型計算機中心，據稱是世界上最大計算機中心，裝有 8 臺
新型 M-200H 電子計算機系統，容量大，外圍設備齊全，分時系統能力很強。由文部省直接支持，為文部省所轄大學服務，這樣就構成了以東京大學為中心的東京都的計算機網絡，統籌計算機的使用和調度。全東京都的大學教師和學生都有資格成為用戶，為大學的教學和研究提供了方便的條件。
東大文獻中心， 1968 年改名為“學術信息中心”，收集全國各
大學的學術研究信息，為高校的學術情報提供服務。
氣候系統研究中心，根據氣候模型進行氣候系統的研究，有 4 個重點學科。
這些全國性***同使用機構，由文部省投資進行設備更新和組織人力，吸收外來人士，包括國外研究學者和國內其它大學教員，設備對外開放，實際上已成為全國性的科學研究中心。
此外，東大還有綜合研究資料館、低溫中心、同位素綜合中心、原子能綜合研究中心、教學用計算機中心、環境安全中心、遺傳實驗室、留學生中心、尖端科學技術中心、人工物理工程研究中心、保健中心等部門。
根據 1992 年 5 月的統計資料，東京大學招收本科生 3638 人，報名者與錄取人數之比為 4.5:1 ，通過非考試特別錄取的學生 44 人；錄取碩士課程學生 1,670 人，錄取率為 2.5:1 ，博士課程學生 937 人，錄取率 1.4:1 ；現在校生為；本科生 16134 人，研究生 7108 人，還有在讀的各國留學生 1554 人。到 1992 年 4 月止，東京大學***畢業了本科生 197,419 人；授予碩士學位 30,970 人，博士學位 9 ， 670 人，論 文 博士學位舊制 11,182 人，新制 10,661 人。另外，尚有各種附屬學校的在校生為：醫學部的護士學校 132 人，助產士學校 20 人；教育學部的附屬中學 356 人；附屬高中 344 人。
同期有教職員工 8,055 人，總長 1 人，教輔 35 人，各種職員（包括行政人員、技術職員、醫務人員中心護士、藥劑師、放射線技師，臨床衛生檢測技師、營養師等） 4,055 人。教員 3964 人中教授 1,133 人，副教授 1,083 人，講師 170 人，助教 1,578 人，教授副教授占教師隊伍的 56% 。
東京大學***有藏書 6,646,133 冊，其中西文書 3,129 ， 050 冊，分藏於全校 60 多個學部、研究所以及有關部門的圖書館和資料中心。中心圖書館藏書近 100 萬冊， 38,600 種期刊，每年全校訂購新書近 20 萬冊。校內***有 3 所科類齊全的附屬醫院；醫學部的附屬醫院，附屬分院，醫學科學研究所的附屬醫院，總***有病床 1246 張。
東京大學校區設在東京都內文京區本鄉，占地面積 40 平方米 ，全校絕大部分機構均在這裏。另外在目黑區駒場另建壹新校區，為教養學部及部分後勤設施所在地。附屬學校、工同研究部門，實驗實習基地（如農場、林場、地震、火山、天文等觀察站）、師生員工宿舍等分布於全國各地。原校本區的舊校門棗紅門所在地，原為江戶時代藩主迎接家庭成員的地方，大門被漆成朱紅色。後經東京大地震和二次大戰的破壞， 1949 年被國家定為重點文物。 1991 年重新修繕壹新，十分有氣派，現紅門成為東京大學的代名詞。
東京大學是日本國內首屈壹指的國立大學，財政主要政府資助。 1979?/FONT>1980 年度政府給東大撥款達 800 億日元，以後逐年增加，每年預算總在千億日元以上。 1991 年度，學校自己收入 352.13 億日元，其來源是附屬醫院收入占 46.4% ；學費 23.6% ；校產折賣，農場、林場收入，承擔外界調查、試驗收入占 30% 。此外，通過科研項目申請得到科研補助費 77.25 億日元。支出*** 1122.03 億日元，各項開支如下：大學附屬醫院占 20.4% ；整個學校事業費 49.5% ；研究所 16.1% ；科研 7.5% ，設備費 6.5% 。
根據“學校教育法”規定，大學設立評議會，為學校最高權力機構。評議會成員由總長、各學部長、直屬部門負責人（如圖書館長、研究所長、研究中心主任、研究生院院長）、每學部兩名教授代表組成。總長為評議長和法人代表，總長、校長兩職合壹。評議會的職責是審議、協調、決定學校重大事項和監督總長工作。行政管理工作經評議會審定後交總長通過行政部門貫徹執行。現任總長為有馬朗人，為東大第 31 任總長。各學部設有教授會，由 全體 教授組成，並吸收部分教職工代表參加，選舉學部長和決定學部壹些重大事項。學校的行政管理系統為：總長 1 人，不設副職，通過總長室兩名特別助理與事務局、學生部、圖書館、各學部、各研究所和研究中心進行協調。事務局為全校行政中心部門，下分規劃部、事務部、經理部、設備部等。政府（實際上是文部省）名義上不幹涉學校具體事務，讓學校自主辦學，由於東大的特殊地位，事實上政府會經常派員到學校部門中任職，加強對學校的人權和財權的控制，以保證對東大的重點領導。
東京大學由於學科齊全，經費充足，教員隊伍整齊，壹些傳統學科辦學水平高，教學和研究的力量與水平是日本其它大學無可比擬的。為迎接新技術革命的挑戰，國家正組織幾所國立大學和有關部門，進行當前及 21 世紀幾項重點項目的***同研究，在這場“重點會戰”中，東京大學無疑起著“領頭羊”的作用。
能源開發研究 日本政府每年投放多達 80 億日元給東大、京都、九州等數所大學進行核聚變的基礎論研究，以此開發新的能源。東大的理學部、原子能所、工學部等單位聯手進行加速器科學、基本粒子、原子能等方面的理論與工程研究並已取得了初步的成果。
宇航研究 以東大宇宙線研究所為首的此項研究近年有較大的開展，日本政府每年撥款百余億日元設備制造費和試驗費，至今已發射了 14 顆衛星和多顆運載火箭，進行極光觀測，探測行星和地球磁場，開展天文物理、無人宇宙實驗室的試驗。
地震火山研究 這項研究在世界上處於領先地位，政府每年撥款 20 億日元進行此項綜合研究，並在東大建立全國性的地震變化資料處理中心，在全國各地地震火山多發地區均設立了裝置先進、預測可靠的觀察所。
海洋研究 1967 年東大海洋研究所建在壹艘大型海洋勘察船，開展海洋勘察和海洋綜合研究，後又建造壹艘更加先進的船，近年來同美國財團合作，進行深海鉆探，重大海洋地殼構成、海底生態、海底資源開發等領域。文部省撥款組織東大等校人員數次參加南極的綜合科學考察。
癌研究 早在 1983 年日本政府提出“癌研究十年計劃”，由東大、東北、大阪等大學參加，並與美國有關研究機構合作，集中對致癌原因、診斷方法、治療途徑三方面進行研究。研究還涉及生物化學、遺傳學、核物理學等學科，東大的醫學科學研究是該項研究中的中堅力量。
社會科學研究分理論研究和比較研究兩方面（由社會科學研究所和東方文化研究所承擔），另外特別集中對中國問題的研究，東方文化研究所 12 個部中就有 9 個部在研究中國問題，從遠古到中華人民***和國、有關的學部中也有不少有關中國的系科專業設置。
東京大學建校以來培養了大量知名人物，據說當代日本知名人士中東京大學的畢業生約占半數以上。
政界為典型，人們說東大是“官僚的溫床”，“總理首相人才的發生地”，“東大培養出來的人掌握著日本政治經濟命脈”。這些說法從字面上看好像誇張了些，事實也確是如此！僅法學部的 4 萬畢業生中就有 2700 人在官廳工作過。日本首相總理大臣中從 1921 年到 1945 年就有 1/3 出自東大，而戰後到今除了少數幾位外，其余均由東大人包攬。他們是：內田原哉、加藤高明、若規禮次郎、濱口雄幸、廣田弘毅、平沼騏壹郎、弊原喜重郎、後藤文夫、原敬（原外務省管轄的法律學校後合並到東大法學部）、吉田茂、片山哲、蘆田均、鳩山壹郎、岸信介、佐藤榮作、福田赳夫、中曾根康弘、宮澤喜壹。在野黨中有***產黨的宮本顯治、不破哲三、上田耕壹郎，社會黨的在田知己，新民連的田英夫、江田五月等均出自東大。在社會活動家中有曾擔任過中日友好協會副會長的向隆坊，“魯迅通”竹內好等。
在科學家中有長岡半太郎（後為大阪大學首任總長）、高木真治、近藤平三郎、小平邦彥、茅城司等知名學者。還有歷史學家井上清，經濟學家大內兵衛。
在文藝方面亦是人才輩出，大文豪中川端康成獲得諾貝爾文學獎，還有夏目漱石、森鷗外、永井荷風、廣津柳浪世界聞名。北樺派有誌賀直哉、菊池寬、芥川龍之介，以後者命名的“芥川獎”為日本國內著名的文學獎。短歌俳句方面有權威正岡子規，詩人上田敏，作家壇壹雄、太宰治、三島由紀夫、小田實、名峙潤壹郎、鈴木三重吾等均是國內受人歡迎的藝術家。此外還有演員山村聰、南原宏治、平田昭彥，歌手加藤登紀予，多才多藝者橋木治等。
在日本較大的公司中任董事長、總經理、部長等重職者尤以舊帝大畢業的人居多，據資產在 10 億日元以上的公司統計，在這些公司中擔任上述重職的人，東大畢業生要數第壹，所以有“東大人掌握國家政治經濟命脈”的說法。
從僅次於諾貝爾獎“日本學士院獎”的獲獎情況亦可看出東大的雄厚學術實力。該獎同諾貝爾獎的不同之處是，它包括自然科學、人文科學、社會科學 12 個學科，從中更可衡量壹個學校的綜合學術優勢。從獲獎者所出身的大學分析， 20 年代是東大的壹統天下，其獲獎人數占全國總獲獎人數的 73.1% ； 30-50 年代盡管有其它幾所舊帝大來分享其成果，但東大的獲獎人數仍占 64.1% ； 50 年代以後，數百所大學與之競爭，但東大獲獎率仍有 50% 左右，穩座“老大”交椅。在 12 個學科領域中，金牌全部由東大人壟斷；除了經濟學科外，其余學科東大人獲獎率均達 50% 左右，其中數學、物理、哲學、法學和政治學均超過 70% 。全國所在獲獎人中曾在東大工作過和正在工作的***有 205 人，占總數的 35.8% ，這些人中絕大部分（占 93.2% ）是東大的畢業生，他們為母校作出自己應有貢獻，給東大校史上添上光輝的壹頁；另外，也有不少東大出身的獲獎者，他們壹畢業之後就進入其它大學工作，也為其他學校贏得了榮譽。
東京大學以其高質量的辦學水平和壹流的學術地位為國內和世界所矚目，現今已成為日本對內對外學術交流中心。國際交流方面，到 1992 年 5 月止，已有 59 個國家和地區 1,554 名留學生來東大學習；東大亦派出了 214 名留學生分赴世界 29 個國家和地區，其中讀學位的 182 人，大部分人是去工業化國家，僅英、美、德、法四國就占 70% 。同世界 18 個國家地區 36 所大學簽訂了校際學術交流協定，之中有中國的北京大學、清華大學、復旦大學和中國社會科學院。學生相互交流的有 8 國 13 所大學。個別學院、部門開展學術交流的有 8 國 14 所大學，其中有中國科學技術大學、北京林業大學、大連理工大學。此外，接受外國的研究人員和訪問學者 1,019 人，大部分來自亞洲的中國、韓國、泰國、印度尼西亞、馬來西來、新加坡和歐洲的英、法、德和前蘇聯等國以及北美的美國、加拿大。
國內交流方面，已接受大學及研究部門的各類進修人員 692 人，其中讀學位的 42 人；東大派出進修和委托其它單位培養的 52 人，研究生院中各研究科同其它大學互換培養研究生為：接受 37 人，派出 18 人。
東京大學是所歷史悠久的著名大學，它保持著傳統大學的特征：多學院、多學科。目前全校的學科差不多全是老學科，辦學水平很高，幾乎所有學科均能授予碩士 和 博士學位。對新建學科和教學上的改革持慎重的態度，他們認為必須保持學校的壹貫傳統，不要人雲亦雲，方能辦出高質量和自己的特色。“以質取勝”，“以質取量”是東大的辦學目標，全校教職員工是這樣認為的：保持學校的穩定和學術上的高水平是維系學校尊嚴和榮譽所不可缺少的。因此他們在培養人才方面著眼於高質量，為達到這個目標，他們采取了壹些措施：為控制學校規模，不宜把學校辦得過大，以維持學校運轉的高效率，目前壹直把本科學生人數控制在 15000 人左右；強調大學在搞好教學同時，開展科學研究，多出世界前沿的學術成果；精心選擇，建設壹支高質量的教授隊伍；教學上強調基礎知識教育，規定 4 年制大學生必須有兩年時間在教養學部學習***同必修基礎課和壹部分專業基礎課；建立導師帶研究生制度，對研究生嚴格要求，同時充滿愛心，悉心指導等等。
東大為適應形勢的發展，現正著手醞釀教育的改革。如 1992 年 4 月理學部、工學部就準備進行體制上的改革，壹改過去那種研究生院在設施、預算、教師等方面依靠學部的傾向，使研究生院擁有人事權、預算權，教師直接歸研究生院管理，並改變以前由少數教授、副教授、助手構成的“講座”為多名教授、副教授組成的大講座。這項改革對加旨學科間綜合、交叉、滲透，加強科學研究方面必將產生深遠影響。另外，“把東大辦成研究生院”的設想，建立本科椦芯可 ?/FONT>6-7 年壹貫制培養體制的呼聲亦得到了全校多數人的響應。以 1991 年為例，在本科畢業生中，就職的占 53.5% ；，進研究生院的有 37.6% 。在日本這樣高的比例不能不讓人刮目相看。
在日本，學生以東大學習為幸，教師以在東大任教為榮，這股風已在東大校園傳播開來，成為東大的壹種無形的凝聚力量。今天，東京大學不僅對國內，而且對世界都有巨大的吸引力，所以，它被作為世界性的壹流大學是眾望的，當之無愧的。