網站抽查中發現的主要問題有:部分網站管理不到位。山西省“大同市南郊區衛生局網”、新疆維吾爾自治區“烏魯木齊市人事考試網”等網站申請關停後，未按規定完成下線流程，仍在違規運行。遼寧省莊河市人民政府同時開設兩個門戶網站，其中壹個網站信息長期不更新。黑龍江省“中國中小企業黑龍江網”於2017年第壹季度被通報不合格後，整改工作未舉壹反三，仍存在空白欄目、鏈接不可用等問題。“國資委建材離退休幹部局網站”首頁長期不更新，且發稿日期造假。福建省“莆田市水利信息網”、河北省“張家口市交通運輸局”網、廣西壯族自治區龍勝各族自治縣“龍勝教育信息網”互動欄目長期不回應。
壹些網站辦事服務水平不高。本次抽查的441家網站中，約10%存在辦事指南信息不完整、不準確問題，如甘肅省定西市“通渭政務服務網”、重慶市“墊江縣市政園林局網”等；約24%存在搜索不準確、不實用，甚至沒有搜索功能的情況，如“住房和城鄉建設部網”“國家糧食和物資儲備局網”“新疆生產建設兵團安全生產監督管理局網”等。
少數網站“我為政府網站找錯”渠道不暢通。市場監管總局“國家企業信用信息公示系統網”、山東省臨沂市“蒙山旅遊區管理委員會網”、遼寧省“遼寧建設工程信息網”、上海市“浦東新區政府采購中心網”等未按規定添加“我為政府網站找錯”平臺入口，未註明網站標識碼等內容，其中“蒙山旅遊區管理委員會網”未在全國政府網站信息報送系統中填報。