1、報關單位向隸屬海關稽查科申請辦理註冊登記註銷時，應提交以下文件資料：
（壹）企業申請註銷報告（應由申請人法定代表人簽章並加蓋公司行政公章）；
（二）《中華人民***和國黃埔海關註銷報關企業（跨關區分支機構）註冊登記許可決定書》（限於報關企業（跨關區分支機構）提交）。
（三）《中華人民***和國海關報關企業報關註冊登記證書》或者《中華人民***和國海關進出口貨物收發貨人報關註冊登記證書》；
（四）報關專用章；
（五）所屬報關員證及卡；
（六）其他相關證明材料。若企業為三資企業的，還應提交本關加工貿易監管部門出具的該企業手冊、料件、設備已核銷完畢，並已辦理終止手續的證明材料。
2、註意事項：
註銷公司肯定要先把國、地稅註銷掉（所得稅在國稅的，先註銷地稅；所得稅在地稅的，先註銷國稅）。
在進行稅務註銷的時候，要清算公司的增值稅、企業所得稅、增值稅附加稅、印花稅等。
如果從來沒有報過稅，那就是每個稅種2000以內的罰款（具體多少和逾期時間有關）。
擴展資料：
2019年2月1日起，《海關單位註冊登記證書》（進出口貨物收發貨人）將被納入“多證合壹”改革，海關不再核發《海關單位註冊登記證書》（進出口貨物收發貨人）書面證書。
申請人因需要辦理海關業務時，在辦理工商註冊登記時，同步辦理《海關單位註冊登記證書》（進出口貨物收發貨人），按照要求勾選進出口貨物收發貨人的備案登記，並補充填寫相關備案信息。
場監管部門按照“多證合壹”完成登記，並完成與海關總署的數據交換。海關確認接收到企業工商註冊信息和商務備案信息後即完成企業備案。企業可以通過中國國際貿易單壹窗口“企業資質”子系統或“互聯網+海關”的“企業管理”子系統查詢海關進出口貨物收發貨人的備案登記結果。
瑞安市商務局-海關取消紙質版《海關單位註冊登記證書》的通知
百度百科-海關對報關單位註冊登記管理規定