機構信用代碼證到期辦理流程如下：首先到銀行櫃臺填寫機構信用代碼證補發申請表，並且提交相關的證明材料，包括機構身份的證明材料和機構的介紹信，以及經辦人的身份證件和復印件。
二、企業申請組織機構代碼證、到期換證、變更、換證須提交材料：
1、企業單位。攜帶各級工商行政管理部門須發的營業執照原件，法定代表及經辦人身份證原件，復印件。變更、換證單位還需提交稅務登記證書原件及復印件。
2、企業分支。攜帶各級工商行政管理部門頒發的營業執照原件、復印件、法人機構年審過的代碼的復印件。變更、換證單位還需提交國稅登記證書原件及復印件。
3、個體工商戶。攜帶各級工商行政管理部門頒發的個體工商戶營業執照原件，復印件、負責人及經辦人身份證原件、復印件、工商所開局的個體工商《開業準許通知書》。變更、換證單位還需提交稅務登記證書原件及復印件。
三、組織機構代碼證過期不去辦理的處罰有哪些？
壹方面會產生罰款，另壹方面，對企業經營各方面都有很大影響。因為，組織機構代碼證是社會經濟活動中的通行證，代碼證對壹個單位來說作用非常重要，對壹個企業來說要想經營，就需要先去稅務部門辦理相關稅務登記手續，同時申請購買發票。而企業稅號的15位數字中，前6位是行政區劃號段，後面9位是企業組織機構代碼號，也就是說辦理稅務登記手續必須使用組織機構代碼證，通過組織機構代碼信息，可以實現對增值稅發票的有效管理，防止個別企業的偷稅漏稅行為。還有在車輛落戶、申請人事調動、辦理員工社會保障時都離不開代碼證。所以，組織機構代碼證應該按時年檢，避免給企業帶來損失。