金稅四期重點稽查內容：1、企業發票問題；2、稅負率異常；3、企業社保繳納問題；4、虛假開戶企業；5、企業的利潤。
1、企業發票問題
國家稅務總局在稅務稽查中，非常重視發票的“三查”問題，即“查稅必查票”“查賬必查票”“查案必查票”，這就要求企業在開票問題上要格外註意“三流壹致”，就是資金流、發票流、合同流相統壹，有的會加上貨物流，也就是四流壹致。
2、稅負率異常
金稅三期下對於企業的稅負率就已經很嚴格，時刻被監控著，不論是過高還是過低都有被稅務局約談和稽查的風險。實務中，雖然企業的稅負率可能受到多個因素的影響，但是壹般情況下企業在某個時期內的稅負率波動不會很大。
3、企業社保繳納問題
去年11月1日開始，多地相繼實施“社保入稅”，在各部門的大數據聯網的情況下，企業的壹舉壹動都被納入了監管系統。
很多企業員工的工資顯示都保持在5000元以下並且長期不變，隨著金稅四期的上線，不論是稅務還是工商、社保等非稅業務都在聯網系統中，數據統壹，試用期不入社保、社保掛靠或代繳社保等行為都是行不通的。
4、虛假開戶企業
隨著企業信息聯網核查系統上線及已經到來的金稅四期，銀行、非銀行支付機構等參與機構可以核實企業相關人員手機實名信息、企業納稅狀態、企業登記註冊信息等重要信息，會多維度的核查企業真實性，了解企業的經營狀況、識別企業是否有開戶資格。
5、企業的利潤
報送的資產負債表與利潤表勾稽關系有出入；利潤表裏的利潤總額與企業所得稅申報表中的利潤總額有出入；企業常年虧損，卻屹立不倒；同行業利潤偏低等。