過去，企業必須在檢驗檢疫部門的業務現場申請紙質通關單，才能向海關申報。通關單無紙化實現後，取消了申領紙質通關單的流程，簡化了法檢貨物的進出口通關操作，減少了往返通關現場的次數。無紙化通關的目標是將單證審核的基礎由傳統的紙質單證改為電子數據，實現無紙化通關。
根據海關規定，除特殊情況外，跨境電子商務《中華人民共和國和中國海關進出口零售商品申報清單》和《中華人民共和國和中國海關進出口貨物報關單》采用無紙化方式申報。
由於跨境電商企業往往需要頻繁申報清單，簽署無紙化報關單將有效提高通關效率，降低通關成本。通關無紙化簽單是通過電子口岸在線簽單系統，實現企業、電子口岸、海關三方電子簽單。
跨境電商企業應首先打開中國電子口岸綜合服務網(www.chinaport.gov.cn)，點擊左側“公共服務”下的“安全技術服務用戶登錄”。進入業務系統後，點擊“通關無紙化網簽”模塊，進入報關員協會。插入IC卡，輸入密碼後進入無紙化網簽平臺；三方協議簽約企業進入“三方協議簽約”菜單後，系統會根據ic卡信息自動填寫其基本信息；用戶選擇壹個海關簽約後，閱讀協議內容，點擊確定，完成“簽約”。