中國海關EDI通關系統是指利用EDI技術在海關與通關對象之間自動交換和處理通關單據，利用海關計算機應用系統及時、自動地完成整個通關過程的EDI實用系統。EDI通關系統涉及進出口貨物的報關、審單、征稅、放行等通關環節，以及報關行、金融機構、倉儲、運輸企業和國際貿易管理部門。EDI通關系統是指對原有報關自動化系統(H883系統)的延伸、發展和完善。在H883系統的基礎上，進壹步簡化了通關手續，很多時候用戶不用派人去海關報關。
中國海關EDI的發展經歷了以下幾個階段:
1.初步調查階段
中國海關在20世紀90年代初開始研究EDI的應用。主要通過廣泛參加國際組織的各種研討會和工作會議，研究EDI在世界上的應用現狀和發展趨勢。壹開始有個大概了解，然後越來越深入，最後基本掌握了實現EDI應用的關鍵技術。例如，通過參加WCO的年度IT工作會議，本文重點對美、英、澳、日等國的EDI通關系統進行了比較研究。20世紀90年代初，中國海關正在全力推進面向海關業務管理的報關自動化系統的應用，上述國家海關相繼進入EDI通關系統的開發應用期，這對中國海關是壹個很大的啟發，認識到海關IT應用的發展方向應該是無紙化EDI通關。
2.研發階段
1992年9月，海關總署辦公會議做出決定，批準EDI通關系統項目正式立項。於是成立了以部門領導為組長的EDI項目領導小組，從全國海關抽調30多名計算機和海關業務專家組成工程組。工程組於1993年3月完成了EDI通關系統所需的14 EDIFACT標準報文子集的制定，並於7月完成了系統的總體技術方案設計。1994從9月到6月，短短五個多月就完成了壹般貨物通關的軟件設計。隨後，6月完成了快遞貨物通關的軟件設計1994 11。1995 1完成了基於微機平臺的普通貨物通關軟件的設計。EDI通關系統分為ALPHA服務器和INTEL服務器兩種。按適用範圍分為普通貨物(海陸空運輸)和快遞貨物(航空運輸)兩種；從EDI應用的深度來看，有的僅限於貨物進出口報關業務，有的用於貨物進出口報關、單證審核和放行業務。
3.試點應用階段
在海關總署的統壹部署下，4月首先在北京首都機場海關1994進行EDI通關系統的試點應用，隨後於9月在上海浦東外高橋保稅區海關進行試點應用。起初，它只用於普通貨物的進出口通關。隨著快遞貨物EDI通關系統的開發成功，該系統分別於1994年底和1995年初在上海虹橋機場海關和北京首都機場海關投入使用。
4.推廣應用階段
EDI通關系統在兩個海關試點成功後，海關總署開始有計劃地推廣。截至1997年底，北京、上海、廣州、深圳、珠海、杭州、寧波、青島、大連、廈門、福州、鄭州等口岸已有十余家海關開通EDI通關服務。EDI通關企業近500家，系統處理的普通貨物日報關量約占全國總量的20%；該系統處理的航空快遞貨物進出口占全國總量的80%以上。
5.到了電子商務發展的階段
在許可證、結匯、出口退稅申報方面，海關總署於8月組織開發了進出口申報網上核查系統，1998。該系統利用中國電信公共數據網，采用WWW服務器技術，具有身份驗證、數字簽名、數據加密、傳輸加密、跟蹤審計等壹整套安全措施。該系統於當年9月逐步推廣。第壹階段，國家外匯管理局和銀行對企業進出口結匯和付匯申報進行檢查。該系統的用戶包括國家外匯管理局及各地分局、國內所有經營售匯和收匯業務的銀行單位以及進出口企業。國家稅務總局和對外貿易經濟合作管理部門將對企業出口退稅申報情況進行公開核查。該系統是國內第壹個在全國範圍內推廣應用並取得實際應用效果的電子商務應用系統。
經過多年的發展，中國海關的EDI電子通關系統從最早的H883系統升級到H2000系統(目前使用的系統)，在技術和功能上都有了質的飛躍。隨著社會經濟的發展，海關總署將對目前的H2000系統進行新的技術創新和系統升級，屆時世界上將出現數據容量最大、運行效率最高的EDI。