1. ERP無力承擔企業之間的集成和協同
但是從80年代開始，壹些重要的化學工業企業如BASF, DOW, Du Pont發現，單靠企業自身生產過程的優化、改進企業內部的管理所獲得的收效變得越來越有限，開始分析為他們供應物料的上下遊企業的活動。90年代，隨著商品市場國際化和競爭加劇，形成了產品用戶化和交付期多變的環境，某些大型制造企業改進管理的焦點轉移到相關的獨立企業之間的協調和企業外部的物流和信息流的集成和優化。
但ERP僅僅是當時多數企業應用的制造資源計劃MRPII而已，推出ERP的術語是為了反映當時的系統比原來有所進步，如加強了按行業的解決方案和擴展了需求管理、產品構型、電子數據交換、現場服務等功能；以及它采用的是client/server結構、關系數據庫和開放平臺等新的計算機技術等。90年代中期，ERP雖然增強了與客戶和供應商業務的交互和Internet能力，但無論在計劃技術基礎或功能方面都不具備協調多個企業間資源的觀念和能力，ERP仍舊是面向企業內部的事物處理系統。
2. ERP計劃模型落後
另壹方面，眾所周知，ERP的計劃管理的模型仍然是MRPII，其編制計劃的方法仍然采用MRP和MPS計算物料的需求、發布補充定單等。這種於60年代出現的用最樸素邏輯、在計算機幫助下按產品BOM和工藝流程逐級推演，得到了在壹般平穩生產條件下可以應用的生產計劃方法，流行了近40年。但是MRP方法存在著以下重要的弱點：
－MRP算法假定提前期是已知的固定值；
－系統要求固定的工藝路線；
－僅僅根據交付周期或日期來安排生產的優先次序；
－所有工作都是在假定無限能力的前提下進行；
－重復計劃過程要花費相當多的時間。而相關計劃的更改十分困難。
另外，MRP極為貧乏的決策支持能力令制造企業的上層管理人員甚為不滿。30多年來MRP的這些缺陷雖然不斷有些技巧性的改進、雖然ERP系統在做生產計劃時考慮了能力資源的約束，但仍舊是壹種串行過程的校驗處理，始終沒有實質性的改變。
在國際化多變的市場面前，MRP的上述缺點顯得愈加突出，傳統ERP的計劃模型越來越不能適應企業變化的需求。對於行業領先的大企業和重要的國際化制造商，替代MRP和擴展ERP是勢在必行的。直至90年代中期，尋求克服ERP缺點的努力開始有了成果，這就是高級計劃與排產技術（Advanced Planning and Scheduling，APS）的實用化和供應鏈管理（Supply Chain Management，SCM）。