在企業的薪酬管理中，可能會遇到各種各樣的問題，這些問題可能是由企業的管理者或員工造成的。如果管理層和員工之間存在矛盾和不信任，管理者之間缺乏溝通，可能會使壹些設計良好的薪酬制度在實際執行過程中的效果大打折扣。經常與員工溝通，吸收員工參與制度設計，促進管理者與員工之間的互信。同時，改變員工對自身薪酬和企業薪酬體系的認識。管理者和員工可以相互理解和包容，共同解決薪酬管理中的問題，有利於集思廣益，創造更加合理和人性化的薪酬體系。
2.薪酬管理要讓員工參與薪酬設計，加強對員工的培訓和教育。
薪酬管理和績效管理密不可分。薪酬管理要想成功，必須有科學有效的績效管理體系和考核方法配合使用。通常，由於績效管理或評估中的問題，優秀的薪酬管理是不夠的。在制定薪酬時，管理者讓員工參與其中。這時候可以在上下級之間提供不同的意見，對員工進行理論知識的教育，使其認識到薪酬的重要性和意義。
3.企業內部薪酬管理體系的靈活性和原則性相結合。
企業的薪酬管理應體現靈活性的特點，即根據企業內部不同的員工采取不同的薪酬標準，同時兼顧企業薪酬的整體原則。根據具體情況采取不同的薪酬管理方式，對績效好、績效高、能力強的員工給予高薪酬，對績效壹般的員工給予中等薪酬水平。這樣可以極大地激勵員工，調動他們的積極性和主動性，為企業創造更多的價值。