個別企業在增值稅發票勾選平臺進行發票勾選時查不到相關發票，可能有以下原因：
（1）開票方離線開票未上傳，請聯系開票方確認開票軟件中對應發票的上傳狀態；
（2）確認本企業是否做了稅號變更，請登錄勾選平臺查看“檔案信息維護”核實；
（3）發票可能為異常發票，請前往“發票查詢”模塊進行核實查詢；
（4）請核實發票號碼、代碼、購方識別號等信息的準確性，確認發票是否開錯。
（5） 由於目前開具的發票信息數據同步到本平臺需要1天，所以平臺中不含當天開具的發票；
（6）銷方離線開具的發票，在本平臺無法查詢到，在銷售方上傳發票至稅務局端後，方可體現在勾選認證平臺中；
若上述情況均不存在，仍然查詢不到該張發票，首先確認是否為增值稅專用發票，在全國發票查驗平臺中查詢發票是否存在。