重慶市中小企業局，全稱為重慶市中小企業發展指導局，對外簡稱中小企業局。
中***重慶市委、市政府從有利於工作部門形成合力，加快全市中小企業、鄉鎮企業、個體私營企業發展的大局出發，決定撤銷重慶市經委中小企業處和市鄉鎮企業管理局，設立重慶市中小企業發展指導局（鄉鎮企業局），實行兩塊牌子、壹套班子的體制，把過去全市中小企業和鄉鎮企業、個體私營企業的指導、服務工作，由壹個工作部門來進行組織實施。2003年02月26日，重慶市中小企業發展指導局（鄉鎮企業局）正式成立 。
重慶市中小企業發展指導局（重慶市鄉鎮企業局）是經中***重慶市委、重慶市人民政府（渝委發20096號、渝編200270號、渝辦發2009191號）批準設立的副廳局級行政單位，實行重慶市中小企業局、重慶市鄉鎮企業局、重慶市非公有制經濟發展領導小組辦公室“三塊牌子壹套班子”的體制。有直屬事業單位2個，分別是重慶市鄉鎮企業幹部學校（重慶市企業管理學校）和重慶市中小企業發展服務中心。