重點排汙單位名錄實行分類管理。根據汙染的環境因素分為五類:水環境重點排汙單位名錄、大氣環境重點排汙單位名錄、土壤環境汙染重點監管單位名錄、聲環境重點排汙單位名錄和其他重點排汙單位名錄。
值得註意的是，同壹企事業單位可以因排汙類型不同而同時屬於不同類型的重點排汙單位。