對於國內和國外頻頻出現的各類大型企業泄密問題，企業微信團隊曾經也表示：安全是企業微信的核心，也是底氣。
企業微信作為騰訊推出的壹款辦公營銷軟件。是國內唯壹通過最高等級公有雲個人隱私保護認證——ISO/IEC27018的企業辦公產品。具有ISO/IEC27001信息安全管理體系認證，率先完成BSI信息安全標準認證“大滿貫”， 企業微信信息安全管理水平已達到國際頂尖級水平。獲得國家信息安全等級保護三級認證，企業微信通過國家對非銀行機構的最高認證，信息數據安全管控能力獲得公安部認可。