專利權質押合同自辦理質押登記時生效。根據相關法律規定，以註冊商標專用權、專利權、著作權等知識產權中的財產權出質的，在辦理出質登記時，質權即成立。
法律客觀性:
《中華人民共和國民法典》第四百四十四條以註冊商標專用權、專利權、著作權等知識產權的財產權出質，質權自出質登記時設立。知識產權中的財產權出質後，出質人不得轉讓或者許可他人使用，但出質人和質權人協商同意的除外。出質人應當向質權人提前清償債務或者交存轉讓或者許可他人使用質押知識產權的價款。