普陀法院現設有立案庭、刑事審判庭、執行局(含執行壹庭、執行二庭)、民事審判第壹庭、民事審判第二庭(商事審判庭)、民事審判第三庭(知識產權審判庭)、民事審判第四庭(房產)、少年庭(未成年人案件審判庭)、行政審判庭、審判監督庭、司法警察大隊、訴調對接中心、政治部、紀檢監察室、辦公室、研究室等***計17個部門。