普陀法院現設有立案庭、刑事審判庭、執行局（含執行壹庭、執行二庭）、民事審判第壹庭、民事審判第二庭（商事審判庭）、民事審判第三庭（知識產權審判庭）、民事審判第四庭（房產）、少年庭（未成年人案件審判庭）、行政審判庭、審判監督庭、司法警察大隊、訴調對接中心、政治部、紀檢監察室、辦公室、研究室等***計17個部門。