1639年，為了紀念學校創始人之壹、學校經費的主要捐助者約翰·哈佛，學校更名為哈佛學院。1780年，哈佛學院被馬薩諸塞州議會提升為哈佛大學，這壹名稱沿用至今，常簡稱哈佛。
現在，哈佛大學規模龐大，資產超強，常被戲稱為哈佛帝國。全校有13個學院。其中有兩個本科學院，分別是哈佛學院和拉德克利夫學院，11個研究生院，分別是文理學院、工商管理學院、肯尼迪管理學院、設計學院、教育學院、法學院、神學院、醫學院、公共衛生學院和大學擴展部等。，牙科學院、醫學院和公共衛生學院除外。高校相對獨立。