不過好景不長，伽利略項目參與國家眾多，人心不齊，效率不高，而更關鍵的是，歐洲對中國仍然持有戒心，擔心和中國研發伽利略系統會對歐洲的國家安全帶來影響，故以知識產權等接口將中國踢出了伽利略衛星導航系統核心成員國的地位。
歐洲把伽利略和中國的合作變成了中國出錢，歐洲研發成功後，中國購買，無法拿到伽利略的核心技術。面對這種荒唐的合作要求，中國並非印度，自然不會答應。所以中國不再寄希望於伽利略系統，開始全力研發北鬥導航系統。
北鬥的研發機構主要是圍繞西安電子科技大學在內的各個光電導航類院校和中國航天光機所等研究所展開，在強大的國家意誌和中國軍工人夜以繼日的努力下，在心往壹處想勁往壹處使，擰成壹股繩的強大動力下，北鬥導航系統迅速獲得了重大突破。